logo好方法网

一种中药贝母DNA提取试剂及提取方法


技术摘要:
本发明公开了一种中药贝母DNA提取试剂,包括核裂解液、CTAB缓冲液和TE Buffer,其中核裂解液包括Tris‑HCl、EDTA、NaCl、PVP‑40、β‑巯基乙醇,与CTAB缓冲液组成相近;本发明DNA提取试剂适用于中药贝母DNA的提取,次生代谢产物去除率高,贝母DNA完整度好;本发明还提  全部
背景技术:
目前,分子生物学技术已被广泛应用于中药材鉴定等方面,其中DNA的提取和纯化 是中药材研究的重要基础,快速有效地大量提取高质量的DNA是是对中药材实施分子标记、 基因文库构建、基因分离以及遗传转化及分子鉴定的重要前提。然而大多数中药材经过加 工处理后,其中所含的DNA可能会受到不同程度的降解,不利于保持DNA的完整性;其次,中 药材含有的次生代谢物很难与DNA分开,会直接影响中药材DNA的提取及后续研究。同种中 药材用不同方法提取的DNA,其纯度和提取效率不尽相同,不同中药材用相同方法提取DNA 的结果也不同。 贝母属为百合科多年生草本植物,大多数种类鳞茎供药用,有清热润肺,止咳祛痰 的功效。该属全世界约有130种,我国有61种(含50个变种,5个变型),其中具有药用价值的 有20余种,常用药材品种主要为川贝母、平贝母、浙贝母和伊贝母等。贝母属植物种间形状 交叉普遍,由于自然条件和地形多变,给传统形态分类带来很大不便,因此,对贝母DNA的分 子检测成为有效分类的方法之一,而如何有效地提取高质量的贝母DNA是保证快速有效分 子检测的前提和基础。目前,对于提取贝母DNA的方法一般有试剂盒法,CTAB法和SDS法。虽 然试剂盒法操作简便且耗时短,但提取出的DNA完整性有时欠佳。因此,本发明在之前CTAB 法的基础上进行改良,建立一种有效和高质量的贝母总DNA提取方法。
技术实现要素:
为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种中药贝母DNA提取试剂,包 括核裂解液、CTAB缓冲液和TE  Buffer,适用于中药贝母DNA的提取,次生代谢产物去除率 高,贝母DNA完整度好; 本发明的另一个目的是提供一种中药贝母DNA提取方法,采用上述提取试剂,以已 有的CTAB法为基础,进行提取试剂配方的改进以及提取步骤的优化,能获高纯度、高质量的 贝母总DNA,提取方法简单易控制,污染少。 本发明的目的采用如下技术方案实现: 一种中药贝母DNA提取试剂,包括核裂解液、CTAB缓冲液、TE  Buffer,所述核裂解 液包括:1mol/L  pH  8.0Tris-HCl  90-110mL、0.5mol/L  pH  8.0EDTA  8-12mL、NaCl  13-16g、 PVP-40  18-22g、β-巯基乙醇1.5-2.5ml,ddH2O定容至1000mL。 优选地,所述核裂解液包括:1mol/L  pH  8 .0Tris-HCl  100mL、0 .5mol/L  pH  8.0EDTA  10mL、NaCl  14.6g、PVP-40  20g、β-巯基乙醇2ml,ddH2O定容至1000mL。 Tris-HCl(pH8.0)主要是提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2 或Mn2 离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高盐环境,使脱氧核糖核蛋白可溶。 进一步地,所述CTAB缓冲液包括:CTAB  28-32g、NaCl  75-85g、0 .5mol/L  pH  3 CN 111575273 A 说 明 书 2/6 页 8.0EDTA  35-45mL、1mol/L  pH  8.0Tris-HCl  95-105mL、PVP-40  18-22g、β-巯基乙醇1.5- 2.5ml,ddH2O定容至1000mL。 优选地,所述CTAB缓冲液包括:CTAB  30g、NaCl  81 .9g、0.5mol/L  pH  8 .0EDTA  40mL、1mol/L  pH  8.0Tris-HCl  100mL、PVP-40  20g、β-巯基乙醇1.5-2.5ml,ddH2O定容至 1000mL。 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形 成复合物,使其分离。 进一步地,所述TE  Buffer包括:1M  pH8 .0  Tris-HCl  Buffer  10mL、0 .5M  pH8.0EDTA  2mL,ddH2O定容至1000mL。 本发明的目的之二采用以下技术方案实现: 一种中药贝母DNA提取方法,包括: 核裂解液预处理:将研磨好的贝母粉与核裂解液混合,剧烈振荡后离心,弃上清 液,得到样本裂解液; CTAB缓冲液处理:向样本裂解液中加入CTAB缓冲液,振荡混匀后,进行恒温孵育。 进一步地,所述贝母粉的质量与核裂解液的体积比为(0.9-1.1):(7.5-8.5)。 所述恒温孵育的条件为:60-70℃金属浴1.2-1.7h。 所述样本裂解液与所述CTAB缓冲液的体积比为(0.8-1.2):(0.8-1.2)。 优选地,所述恒温孵育的条件为:65℃金属浴1.5h。 相比现有技术,本发明的有益效果在于: 1、本发明中药贝母DNA提取方法在CTAB处理前先进行贝母核裂解预处理,核裂解 液配方与后续的CTAB缓冲液近似,可减少DNA的降解;核裂解液中加入了PVP-40(聚乙烯吡 咯烷酮)和β-巯基乙醇复合作用,在核裂解阶段即进行次生代谢产物的分离,去除效果更 好,更能保持贝母DNA的完整性;CTAB缓冲液中添加PVP-40和β-巯基乙醇复合作用,进一步 去除核酸提取液中的次生代谢产物。其中,PVP-40是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的 络合物,有效去除待提取样本中的多酚,减少DNA中酚的污染,同时它也能和多糖结合,有效 去除多糖;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效防止酚氧化成醌,避免褐变,并使酚更多的与PVP- 40络合,使酚更容易去除。 2、CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸 形成复合物;它具有从低离子强度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,在该条件下,蛋 白质和中性多聚糖仍留在溶液里。该复合物在高盐溶液中(NaCl>0.7mol/L)是可溶的,通过 有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸从中分离出来。 3、本发明中药贝母DNA提取方法进一步优化了处理试剂、处理温度、处理时间等工 艺参数,其中所有温度反应均在恒温金属浴上进行,温度恒定,控温准确、稳定性高并且节 能无噪音,同时还可以避免因可能引入水浴锅的水而导致样品污染的问题。此外,恒温金属 浴还可以设置固定转速的水平转动,无需手动颠倒混匀,使得样本细胞裂解效果更佳。 附图说明 图1为本发明实施例1-2和对比例2提取的DNA的琼脂糖凝胶电泳图; 图2为本发明实施例1-2提取的DNA的PCR扩增产物电泳图。 4 CN 111575273 A 说 明 书 3/6 页
下载此资料需消耗2积分,
分享到:
收藏