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一种用于生产(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的酮还原酶突变体


技术摘要:
本发明公开了一种用于生产(R)‑4‑氯‑3‑羟基丁酸乙酯的酮还原酶突变体,属于生物技术领域,其源于Meyerozyma guilliermondii的野生型酮还原酶,能将4‑氯乙酰乙酸乙酯转化生成(R)‑4‑氯‑3‑羟基丁酸乙酯,与野生型序列相比具有更高的醇脱氢酶活性,该酮还原酶突变  全部
背景技术:
酮还原酶是一种多用途催化剂,通过醛或酮的对映体选择性还原成对应醇。  (R) 特异性酮还原酶与(S)特异性酮还原酶具有不同特性,并且这些催化剂在光学活性醇的工 业合成中被越来越频繁地用到。旋光性是许多医药和农药活性化合物选择性作用的必要条 件,在一些情况下,一个对映体具有有益的药物活性,另一个对映体却具有基因毒性作用。 因此,在药用和农药用活性化合物的合成中,需要使用具有所要求的立体特异性的催化剂 合成光学活性醇。 手性纯的(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯是一种重要的手性醇。(R)-CHBE(4-氯-3-  羟 基丁酸乙酯)已经被用作(R)-肉碱,R-4-氨基-3-羟基丁酸,(R)-4-羟基-2-吡咯烷酮和其他 五烯化学品的主要前体。并且近年来有报道将(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯用于超级他汀类 药物的新合成路线,有望打破原合成工艺的专利垄断。一些属于SDRs的氧化还原酶已被筛 选并应用于生物还原4-氯乙酰乙酸乙酯为CHBE  (4-氯-3-羟基丁酸乙酯)。大多数报道的微 生物酶产生的都是(S)型CHBE,并同时具有高对映选择性和高产率。但是,仅有极少有酶能 产生(R)型CHBE,并伴随立体选择性较低(如70%e.e.)或产率低等特性。许等人报道了一株 产酮的芽孢杆菌还原酶,其中一个羰基还原酶能转化COBE为(R)-CHBE(99.6%e.e.),收率 为91.7%,但是需要用到水-甲苯两相系统底物需要分三次加入反应体系,增加了生产成本 并加重了生产负担;并且该催化体系活力偏低,需要依赖投入大量的酶或细胞才能使反应 结束(0.5g干细胞催化2.158g底物),对于市场需用量大价格低廉的中间体CHBE来说该工艺 几乎不具有放大前景。 日本人Kataoka等使用Sporobolomyces  salmonicolor来源的酮还原酶被用来做 (R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯,底物浓度高达300gL,但是只有92%的手性纯度,无法应用于对 手性纯度高要求的药物合成。 中国专利CN104988085A利用(R)4-氯-3-羟基丁酸乙酯及其衍生物的生物合成方 法,以4-氯乙酰乙酸乙酯(COBE)及其衍生物为起始原料,利用重组E.coli CCZU-H15静息细 胞为生物催化剂,以葡萄糖为辅底物,实现了(R)-CHBE及其衍生物的合成。 中国专利CN103160547中利用Candida  albicans来源的醇脱氢酶不对称还原  4- 氯乙酰乙酸乙酯制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯,以醇脱氢酶为催化剂,以4-氯乙酰乙酸乙 酯为底物,以NADH为辅因子,不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。但是底物浓度仅为 25g/L-50g/L,且投酶量过高(5g菌体/25ml体系),转化率低,不具备工业生产前景。
技术实现要素:
本发明的主要目的是为了提供一种用于生产(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的酮还原 3 CN 111575256 A 说 明 书 2/9 页 酶突变体。 本发明的目的可以通过采用如下技术方案达到: 一种用于生产(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的酮还原酶突变体,其源于  Meyerozyma  guilliermondii的野生型酮还原酶,能将4-氯乙酰乙酸乙酯转化生成  (R)-4-氯-3-羟基丁 酸乙酯,与野生型序列相比具有更高的醇脱氢酶活性,与SEQ ID  NO.8具有90%以上相似性 且具有以下特征中的一个或多个突变:R13K,  G77D,N89G,T92A,L97N,F131Y,T138P,L146I, G149N,L150V,M154V,  V157A,L166Y,V169I,H170K,L176V,A180S,N200A,Y201F,C203A,  C208V,C247V,G248S,L278F,S283L,R285L,G295W,W307L,T309S,  Q327E,K330E,R331K,该酮 还原酶突变体的序列为SEQ  ID  NO.2。 一种用于生产(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的酮还原酶突变体,该酮还原酶突变体 的酶活性比野生型酮还原酶的活性至少增强2-10倍。 一种多核苷酸,该多核苷酸的编码由序列为SEQ  ID  NO.2的酮还原酶重组的多肽。 一种多核苷酸,该多核苷酸的序列为SEQ  ID  NO.1。 一种重组质粒,包括表达载体连接序列为SEQ  ID  NO.1的多核苷。 一种宿主细胞,其包含所述的重组质粒。 一种宿主细胞,该细胞是一种大肠杆菌。 一种宿主细胞,所述重组质粒的密码子已经为在宿主细胞中表达而进行优化了的 密码子。 一种生产(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的方法,包括在与序列为SEQ  ID  NO.2 的酮 还原酶突变体的存在下,将4-氯乙酰乙酸乙酯转化生成(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯。 本发明的有益技术效果: 本专利提供一种医药中间体(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的制备方法,整个体系使 用单酶或双酶催化,使用葡萄糖或醇类用于辅酶循环,底物浓度高达  120g/L-200g/L,手性 纯度大于99%,底物用量/NAD用量高达3017∶1,辅酶循环次数高,使得(R)-4-氯-3-羟基丁 酸乙酯生产成本接近(S)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯,有效的扩大了下游应用范围。 本发明人发现,微生物Meyerozyma  guilliermondii中天然存在的野生型酮还原 酶,具有将4-氯乙酰乙酸乙酯转化生成(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的潜力。本公开内容的发 明人已发现包括在一定位置突变的酮还原酶与Meyerozyma guilliermondii产生的野生型 酮还原酶(SEQ  ID  NO:8)相比表现出增加的催化活性。″野生型酮还原酶″、″野生型KRED酶″ 及″野生型KRED酮还原酶″指由源自Meyerozyma  guilliermondii的具有SEQ  ID  NO:8氨基 酸序列的酮还原酶。该酶可将4-氯乙酰乙酸乙酯转化生成(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯。″野 生型″指与自然中所发现的一样的材料或物质的形式。实施例如野生型的蛋白质或核酸序 列是可以从自然界中的分离并且未经过人为修饰的,在生物体中存在的原始序列形式。″增 加的催化活性″指在体外或体内试验中所测量的与野生型酮还原酶相比,表现出使底物(实 施例如4-氯乙酰乙酸乙酯)向产物(实施例如(R)-4- 氯-3-羟基丁酸乙酯)转化速率增加的 酮还原酶。 本发明提供一种酮还原酶突变体,其源于Meyerozyma  guilliermondii的野生型 酮还原酶,表现出使底物(实施例如4-氯乙酰乙酸乙酯)向产物(实施例如  (R)-4-氯-3-羟 基丁酸乙酯)转化速率增加的酮还原酶。所述酮还原酶突变体,与  SEQ  ID  NO.8的野生型酮 4 CN 111575256 A 说 明 书 3/9 页 还原酶相比表现出更强的催化活性。酮还原酶突变体和编码这种突变体的多核苷酸可以使 用本领域技术人员通常使用的方法制备。突变体可以通过使编码该酶的体外重组、多核苷 酸诱变、DNA改组、易错PCR和定向进化方法等获得。 上述酮还原酶突变体,具有选自以下特征中的一个或多个突变: R13K,G77D,N89G,T92A,L97N,F131Y,T138P,L146I,G149N,L150V,M154V,V157A, L166Y,V169I,H170K,L176V,A180S,N200A,Y201F,  C203A,C208V,C247V,G248S,L278F, S283L,R285L,G295W,W307L,  T309S,Q327E,K330E,R331K。 上述酮还原酶突变体,优先自序列SEQ  ID  NO.2,全长突变的酮还原酶对于保持酶 的催化活性并不是必需的。相应地,应考虑酮还原酶突变体的截短的类似物和有催化活性 的片段。实施例如,在一些实施方案中,C端或N端的数个氨基酸可以被删去。任何特定的截 短的类似物或片段可以利用相应的试验来评估催化活性。同样的,额外的氨基酸残基可以 被添加到一个或两个末端而不影响催化活性。额外序列可以是功能性的或非功能性的。实 施例如,额外氨基酸序列可以被用来帮助纯化,做为标记,或执行一些其它的功能。因此,本 公开内容的酮还原酶突变体可以是融合蛋白的形式,其中酮还原酶突变体(或其片段)诸如 通过助溶标签(如SUMO蛋白)、纯化标签(如结合金属的His标签)  和细菌定位信号(如分泌 信号)的实施例而非限制的方式被融合到其它蛋白质。 本发明提供一种酮还原酶突变体,其酮还原酶活性比野生型酮还原酶的活性至少 增强2-10倍。 上述酮还原酶突变体编码序列,其优选自SEQ  ID  NO.1,其已经过序列优化以适于 在大肠杆菌中表达。在一些实施方案中,多核苷酸包括被优化用于在特定类型的宿主细胞 中表达的密码子。用于各种不同类型的微生物的密码子的使用和偏好性是已知的,因为其 是用于在这些微生物的表达特定的氨基酸的优化的密码子。本发明提供一种重组质粒,在 一些实施方案中,控制序列包括启动子、前导序列、多腺苷酸化序列、前肽序列、信号肽序列 和转录终止子等。对于细菌宿主细胞,指导编码序列的转录的适合的启动子包括但不限于 从噬菌体  T5、噬菌体T7、噬菌体lambda、大肠杆菌lacUV5操纵子、大肠杆菌trp操纵子、大肠 杆菌tac操纵子等。 附图说明 图1为Mgu-3的表达质粒图谱。 图2为Mgu-CK,Mgu-1,Mgu-2,Mgu-3,生物转化反应21小时的TLC 图谱,从左至右依 次为Mgu-CK,Mgu-1,Mgu-2,Mgu-3,上方黄色条带为底物,下方白色条带为产物。 图3为Mgu-2在不同反应条件下生物转化20小时的TLC图谱,从左至右依次为实施 例12,实施例13,实施例14,实施例15的反应结果。 图4为Mgu-3在200g/L底物浓度下生物转化5.5小时的TLC图谱,从左至右依次为实 施例16,实施例17,实施例18的反应结果。 图5为手性检测图谱,自上而下依次为S型标准品,R型标准品,对照反应实施例19 产物,实施例10产物。 5 CN 111575256 A 说 明 书 4/9 页
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