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技术摘要:
本发明公开了一种小鼠短串联重复序列的多重扩增体系,该多重扩增体系中包含18对引物,可同时扩增18个小鼠的STR位点。本发明还包括由所述多重扩增体系构成的检测试剂盒。本发明所述多重扩增体系通过一次扩增即可获得大量信息;扩增产物带有荧光,可直接在测序仪上进行检 全部
背景技术:
从第一株实验室培养的细胞系诞生后不久,就一直有关于细胞系交叉污染问题的 文章及报道。曾有文献作者根据检测结果估算,全球在用的细胞系有高达20%至33%是被 错误标记或辨识。从2015年开始,多家科学界权威杂志社陆续要求撰稿人需要对所使用的 细胞系提供鉴定报告,以证明所使用的细胞系没有交叉污染或被错误标记。之后,细胞系交 叉污染问题才得到广大科研工作人员的重视。近来,使用错误细胞系的情况虽有所改善,但 仅仅是对于人源细胞系而言;对于其他种属的细胞,因为没有统一的数据库或没有稳定的 检测体系等,情况一直没有很大的改善。而大量的未经鉴定的非人源细胞系的使用,同样会 造成科研时间和经费的浪费,同时也会导致错误结论或误导其他科研人员。 短串联重复序列(STR)检测已广泛应用于亲缘鉴定、法医鉴定等检测中;而且在人 源细胞系的鉴定中也非常成熟,并已建立起了统一的STR位点信息数据库,可供广大科研人 员查询和比对。 小鼠细胞系是除人源细胞系外使用最多的一类细胞系。虽然小鼠已有全基因组序 列,但仍没有一个标准的STR Marker组合和标准数据库可以检索。 在2016年,专利CN105648100A,更新了小鼠短串联重复序列的复合扩增体系及检 测试剂盒,包含9个位点和一个性别判定位点。但9个位点所能提供的分辨率对于数量庞大 的小鼠个体来说是远远不够的,并不确保能把每只小鼠个体区分开来。这对小鼠细胞系及 小鼠个体的鉴定来说都是不利的,亟需开发针对更多位点的小鼠短串联重复序列多重扩增 体系及检测试剂盒。
技术实现要素:
本发明的目的是为了解决上述现有技术的缺点和不足,提供一种小鼠短串联重复 序列的多重扩增体系及检测试剂盒,通过鉴定小鼠的STR位点来鉴定小鼠细胞系。 本发明是通过以下技术方案来实现的: 一种小鼠短串联重复序列的多重扩增体系,包含18对引物,可同时扩增18个小鼠 的STR位点Mmus-1、Mmus-2、Mmus-3、Mmus-4、Mmus-5、Mmus-6、Mmus-7、Mmus-8、Mmus-9、Mmus- 10、Mmus-11、Mmus-12、Mmus-13、Mmus-14、Mmus-15、Mmus-16、Mmus-17、Mmus-18;所述引物分 别为: 扩增Mmus-1的上游引物:AGCTATCAGAGATGCCCCCT(SEQ ID NO:1); 扩增Mmus-1的下游引物:GACAGATAGTGAACTCTAGG(SEQ ID NO:2); 扩增Mmus-2的上游引物:CTACAGTCTTTCTGTCTTT(SEQ ID NO:3); 扩增Mmus-2的下游引物:GGACTTTGGGGGGGAGGTT(SEQ ID NO:4); 5 CN 111718999 A 说 明 书 2/13 页 扩增Mmus-3的上游引物:CTTTGCTGGAAAGAGAAAGAG(SEQ ID NO:5); 扩增Mmus-3的下游引物:CATTCTAAAGTTCCTGCTTAGC(SEQ ID NO:6); 扩增Mmus-4的上游引物:GGAGTTACAGATAGTTGTGAGC(SEQ ID NO:7); 扩增Mmus-4的下游引物:ATGGATAGATACATACATCC(SEQ ID NO:8); 扩增Mmus-5的上游引物:GGCAGGACAGGTGGTGACAAG(SEQ ID NO:9); 扩增Mmus-5的下游引物:TGACATTTAATTTTTCTTGTAACCC(SEQ ID NO:10); 扩增Mmus-6的上游引物:CACTTCCTGGGCCGGTGGCT(SEQ ID NO:11); 扩增Mmus-6的下游引物:AACTTCCCCTTCCTGGTGTGG(SEQ ID NO:12); 扩增Mmus-7的上游引物:GAAAAGTGAAGTTGTTTGCA(SEQ ID NO:13); 扩增Mmus-7的下游引物:CTTAGGTAGTTCCAATACTT(SEQ ID NO:14); 扩增Mmus-8的上游引物:AGTGGAGAAGAGGGAGCGCAAT(SEQ ID NO:15); 扩增Mmus-8的下游引物:GATTACAAGTGACCTCAGTTG(SEQ ID NO:16); 扩增Mmus-9的上游引物:TTTGACCCAACACCAGTTG(SEQ ID NO:17); 扩增Mmus-9的下游引物:GGAATCCTAGTCCCCAACTGGT(SEQ ID NO:18); 扩增Mmus-10的上游引物:GGCCACCTATGTTAGTGATCC(SEQ ID NO:19); 扩增Mmus-10的下游引物:TACCCCAAAATGGTCTAGAG(SEQ ID NO:20); 扩增Mmus-11的上游引物:TTCACAGTCCTGACACAGGG(SEQ ID NO:21); 扩增Mmus-11的下游引物:TAGGAGACAGAGTCTCACC(SEQ ID NO:22); 扩增Mmus-12的上游引物:AGGTCATAAATTGTCAATTT(SEQ ID NO:23); 扩增Mmus-12的下游引物:CCTTGTTCAATATCAGAAT(SEQ ID NO:24); 扩增Mmus-13的上游引物:GGTATTAACCCAAGTCCTTGAG(SEQ ID NO:25); 扩增Mmus-13的下游引物:ATCCCCATAAACCATAAGCC(SEQ ID NO:26); 扩增Mmus-14的上游引物:TGTCTGTCATAAATAAGGTAG(SEQ ID NO:27); 扩增Mmus-14的下游引物:AGATCAAGAGGCTATCTAAAC(SEQ ID NO:28); 扩增Mmus-15的上游引物:CCATCCTGGCATGTCTCTAC(SEQ ID NO:29); 扩增Mmus-15的下游引物:TGATAAACTAAATCTGATCCCC(SEQ ID NO:30); 扩增Mmus-16的上游引物:GTGTCATGCTAACTCACAGGTA(SEQ ID NO:31); 扩增Mmus-16的下游引物:AATCACCAGGTCTGCTAAAT(SEQ ID NO:32); 扩增Mmus-17的上游引物:ACATGTACCAGTCCTCAAGGC(SEQ ID NO:33); 扩增Mmus-17的下游引物:CTGGTGCTCACAGCACTGAGT(SEQ ID NO:34); 扩增Mmus-18的上游引物:TAGCCAAGATATGCAAAGAAC(SEQ ID NO:35); 扩增Mmus-18的下游引物:GCATTATCATATTCATGACT(SEQ ID NO:36)。 进一步地,所述多重扩增体系还包括一对能扩增小鼠性别判定位点Kdm5的引物, 分别为: 扩增Kdm5的上游引物:GAAGCTTTTGGCTTTGAGC(SEQ ID NO:37); 扩增Kdm5的下游引物:CCGCTGCCAAATTCTTTGG(SEQ ID NO:38)。 进一步地,上述19对引物被分为四组,每组引物带有不同的荧光标记物,且四组引 物分别在每一对引物的上游引物5‘末端添加相应颜色的荧光标记物;所述第一组为Mmus- 16、Mmus-5、Kdm5、Mmus-8和Mmus-17;第二组为Mmus-2、Mmus-9、Mmus-1、Mmus-4和Mmus-10; 6 CN 111718999 A 说 明 书 3/13 页 第三组为Mmus-3、Mmus-14、Mmus-7和Mmus-11;第四组为Mmus-15、Mmus-12、Mmus-6、Mmus-18 和Mmus-13。 进一步地,所述第一组、第二组、第三组和第四组引物分别采用不同的荧光标记, 所述四组引物的荧光标记可以从6-FAM、VIC、NED、PET随机组合,或从FL、JOE、TMR、CXR随机 组合。 进一步地,所述多重扩增体系还包括:PCR反应缓冲液、模板DNA和Taq酶。 更进一步地,所述Taq酶为热启动适合多重位点扩增用Taq酶。 本发明还包括小鼠短串联重复序列的多重扩增检测试剂盒,包括上述多重扩增体 系。 进一步地,所述试剂盒的引物有19对,其用量体积比如下: 引物扩增的位点名称 各引物体积(μl) Mmus-1 7.5μl Mmus-2 11.25μl Mmus-3 6.25μl Mmus-4 10μl Mmus-5 10μl Mmus-6 12.5μl Mmus-7 10μl Mmus-8 10μl Mmus-9 10μl Mmus-10 10μl Mmus-11 10μl Mmus-12 10μl Mmus-13 12.5μl Mmus-14 5μl Mmus-15 10μl Mmus-16 7.5μl Mmus-17 10μl Mmus-18 13.75μl Kdm5 10μl 进一步地,所述试剂盒的多重扩增体系具体如下: 无核酸酶纯水 8.5μl 2x PCR反应缓冲液 12.5μl 引物混合物(PrimerMix) 2.5μl Taq酶 0.5μl 模板DNA 1μl 总计 25μl 本发明的优势在于: 1、一次扩增即可获得19个位点的大量信息。 7 CN 111718999 A 说 明 书 4/13 页 2、扩增产物带有荧光,可直接在测序仪上进行检测,结果准确,重复性高,数据可 建立标准参考数据库。 3、操作简便,需时短,易于规模化及自动化。 为了更好地理解和实施,下面结合附图详细说明本发明。 附图说明 图1是小鼠4T1细胞的STR图谱。 图2是小鼠BV2细胞的STR图谱。 图3是小鼠CT26.WT细胞的STR图谱。 图4是小鼠Hepa1-6细胞的STR图谱。 图5是小鼠L929细胞的STR图谱。 图6是小鼠M-1细胞的STR图谱。 图7是小鼠MS1细胞的STR图谱。 图8是小鼠NIH/3T3细胞的STR图谱。 图9是小鼠P19细胞的STR图谱。 图10是小鼠RAW264.7细胞的STR图谱。 图11是小鼠Renca细胞的STR图谱。 图12是小鼠SP2/0-Ag14细胞的STR图谱。 图13是中国仓鼠CHO-K1细胞的STR图谱。 图14是大鼠H9C2细胞的STR图谱。 图15是人源SK-OV-3细胞的STR图谱。